ウイルスのゲノム解析

日本のコロナウイルスは、その５％から１０％しかゲノム解析[^1]されていません。大半の検体はゲノム解析に回されないので、最初に変異株が見つかるのはもっぱら空港で陽性となった検体です。空港検疫での陽性検体は必ずゲノム解析に回すので、あたかもそこが最初の検出場所のように見えます。でも南アフリカがオミクロン株を公表する前に、オランダでそのウイルスに感染した人がいた事[^2]が分かっています。日本の変異株スクリーニング検査で使っている試薬ではオミクロン株を検出できないので、最近の国内検体をゲノム解析すればオミクロン株が見つかる可能性があります。ただし今のところこの変異株による重症化は世界的に報告されていません。

^1: https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUA294IG029112021000000/

^2: https://www.nikkei.com/article/DGXZQOGR30DTG0Q1A131C2000000/

2021年12月03日追記

https://www.nikkei.com/article/DGXZQOCC034VK0T01C21A2000000/

「東京都、オミクロン対応のPCR検査開始　1日以内で判別」朗報です。